Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Usp29Q9ES63 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Usp29Q9ES63 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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