Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

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Length 162 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SelenofQ9ERR7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms