Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Barx1Q9ER42 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Barx1Q9ER42 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms