Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SgshQ9EQ08 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SgshQ9EQ08 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms