Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tlr6Q9EPW9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms