Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hmgn3Q9DCB1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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