Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riok3Q9DBU3 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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