Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Xrn2Q9DBR1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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