Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB54

Fam216a, Protein FAM216A, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam216aQ9DB54 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam216aQ9DB54 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms