Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pop5Q9DB28 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Pop5Q9DB28 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms