Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnn3Q9DAW9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms