Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TrmuQ9DAT5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms