Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem239Q9DA47 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms