Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Cldn34b2Q9D9N2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms