Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Usp12Q9D9M2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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Usp12Q9D9M2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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Usp12Q9D9M2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Usp12Q9D9M2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms