Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Tube1Q9D6T1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tube1Q9D6T1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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