Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc94Q9D6J3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc94Q9D6J3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms