Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb4aQ9D6F9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms