Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptp4a3Q9D658 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptp4a3Q9D658 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptp4a3Q9D658 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptp4a3Q9D658 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptp4a3Q9D658 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptp4a3Q9D658 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptp4a3Q9D658 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ptp4a3Q9D658 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ptp4a3Q9D658 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptp4a3Q9D658 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms