Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rab11fip1Q9D620 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rab11fip1Q9D620 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rab11fip1Q9D620 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rab11fip1Q9D620 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rab11fip1Q9D620 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rab11fip1Q9D620 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rab11fip1Q9D620 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rab11fip1Q9D620 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rab11fip1Q9D620 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab11fip1Q9D620 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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