Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms