Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms