Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Tmed11Q9D2R4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tmed11Q9D2R4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed11Q9D2R4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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