Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D1F3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q9D1F3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q9D1F3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms