Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Syf2Q9D198 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms