Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem53Q9D0Z3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tmem53Q9D0Z3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms