Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Zbed3Q9D0L1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Zbed3Q9D0L1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zbed3Q9D0L1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms