Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gtf2e1Q9D0D5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms