Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms