Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ube2fQ9CY34 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ube2fQ9CY34 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ube2fQ9CY34 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms