Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpl11Q9CXW4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms