Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
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Sgo1Q9CXH7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sgo1Q9CXH7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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