Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9CWU4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9CWU4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Q9CWU4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms