Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
NubplQ9CWD8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms