Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Smurf1Q9CUN6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms