Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rprd1bQ9CSU0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rprd1bQ9CSU0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms