Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pard3bQ9CSB4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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