Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ifitm3Q9CQW9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms