Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccer1Q9CQL2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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