Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nudt21Q9CQF3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nudt21Q9CQF3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms