Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Atp6v0e1Q9CQD8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atp6v0e1Q9CQD8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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