Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Use1Q9CQ56 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Use1Q9CQ56 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Use1Q9CQ56 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Use1Q9CQ56 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms