Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp3Q9CQ10 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp3Q9CQ10 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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