Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80bQ99PT3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms