Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim26Q99PN3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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