Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Smim3Q99PE5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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