Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup155Q99P88 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup155Q99P88 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms