Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cntnap4Q99P47 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms