Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NsmfQ99NF2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms