Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

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Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp26Q99MX1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Usp26Q99MX1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp26Q99MX1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp26Q99MX1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp26Q99MX1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp26Q99MX1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp26Q99MX1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp26Q99MX1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp26Q99MX1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Usp26Q99MX1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp26Q99MX1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Usp26Q99MX1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms